6163银河主站体育学院肇始于1983年成立的西昌师范高等专科学校体育系，是四川省综合性大学中最早开办体育专业的高校。1999年，原体育系根据人才培养需要，开设三年制体育教育专科专业。2003年，伴随四校合并组建本科层次的6163银河主站，体育系正式更名为6163银河主站体育系，2005年，学院开始招收体育教育本科专业学生和社会体育专科专业学生。2008年，社会体育指导与管理本科专业开始招生，学院专业布局进一步拓展，办学规模持续扩大。2009年，按照学校二级学院设置改革要求，6163银河主站体育系正式更名为6163银河主站体育学院。2010年通过教育部本科教育教学合格评估，2018年和2025年顺利通过教育部本科教育教学第一轮和第二轮审核评估，2024年体育教育专业通过教育部师范专业二级认证。2022年运动康复专业第一届招生，运动促进健康专业培养体系初步形成。2026年，经教育部审批，学院新增运动训练国家控制布点专业，成为该单招专业川内唯五、川西唯一的布点高校之一。这一专业的获批，是学院办学历史上的重要突破，标志着学院竞技体育人才培养能力和体育特色专业建设水平迈上新台阶。至此，学院形成了涵盖运动康复、体育教育、运动训练、社会体育指导与管理的体育特色专业集群，构建起“运动促进健康+学校体育、竞技体育、全民健身”的“1+3”专业新格局，为服务体育强国战略、健康中国战略和区域体育人才培养提供了更加有力的专业支撑。进入新时代，学院坚持以服务体育强国、健康中国和区域体育事业发展为导向，依托西昌亚高原地域优势、凉山天然山水生态资源和民族地区体育文化特色，持续推进“体教融合、产教融合、体医融合”培养模式，凝练“中国亚高原体育”为核心的学科发展方向，着力提升人才培养质量、运动训练水平、社会服务能力和科研支撑能力。经过四十余年的建设与发展，体育学院已由单一体育教育专业办学单位发展成为集体育人才培养、科学研究、运动训练与竞赛、社会服务于一体的综合性二级学院。